Le réseau ferroviaire est exploité par la CCF (Compagnie des Chemins de Fer). La Gare Centrale de la Métropole est le point de correspondance majeur du réseau ferroviaire à l’échelle régionale.
Sur le territoire de la Métropole, voici les points d’arrêt desservis :
Des correspondances avec le réseau Koalabus sont possibles aux points d’arrêt suivants :
| Gare | Arrêt | Agence | Ligne(s) |
|---|---|---|---|
| Gare Centrale | Gare Centrale | oui |       |
| Gare de l’Ouest | Gare de l’Ouest | oui |                |
| Gare de l’Aéroport | Aéroport | oui |  |
| Gare de l’Est | Gare de l’Est | non |   |
| Gare de Lusignol | Gare de Lusignol | oui |  |
Lors d’interruptions pour travaux sur le réseau ferroviaire, la CCF sous-traite à Koalabus l’organisation et l’exploitation du transport de substitution.